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| Registros recuperados : 29 | |
| 1. |  | OTTO, P. I.; OLIVEIRA, R. A. de; NEGRI, R.; MELLO, F. C. B.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação do período gestacional para a facilidade de partos em bovinos Girolando. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 447-450. IX SIMLEITE.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 2. | | OLIVEIRA, L. A. da S.; TEMP, L. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; OTTO, P. I. Impacto da inclusão de informações genômicas na avaliação genética para produção de leite na raça Girolando. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2021, Diamantina. Zootecnia em tempos de pandemia: oportunidades e desafios. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | BÖCK, M. J.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; NEGRI, R.; OTTO, P. I. Diversidade genética das raças Holandesa, Pardo-Suíça e Jersey no Brasil. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 454-456.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | BÖCK, M. J.; OLIVEIRA, A. A. de; GODO, D. O. R.; SILVA, M. V. G. B.; MELO, T. P. de; MELLO, F. C. B.; OTTO, P. I. Melhoramento genético: da base mendeliana para produção animal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 32., 2023, Natal. Anais... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas; Natal: Universidade Federal Rural do Semi-Árido, 2023. Zootec 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | TEMP, L. B.; OLIVEIRA, L. A. da S.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; OTTO, P. I. Seleção genômica para predição do mérito genético para características reprodutivas na raça Girolando. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2021, Diamantina. Zootecnia em tempos de pandemia: oportunidades e desafios. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | BÖCK, M. J.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; NEGRI, R.; OTTO, P. I. Padrão de ancestralidade nas raças Holandesa, Jersey e Pardo-Suiça. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 476-478.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | CARVALHO, B. C. de; BRANDÃO, F. Z.; SANTOS, G. B.; VARAGO, F. C.; OTTO, P. I.; VARGAS, M. W.; GRÁZIA, J. G. V.; CAMARGO, L. S. de A. Oocyte quality in post-partum of 3/4 and 7/8 Holstein x Zebu primiparous crossbred cows. Animal Reproduction, v. 10, n. 3, p. 559, Jul./Sept. 2013. Suplemento. Edição dos abstracts do 27º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2013, Praia do Forte, BA.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | OTTO, P. I.; GUIMARÃES, S. E. F.; CALUS, M. P. L.; VANDENPLAS, J.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Single-step genome-wide association studies (GWAS) and post-GWAS analyses to identify genomic regions and candidate genes for milk yield in Brazilian Girolando cattle. Journal of Dairy Science, v. 103, n. 11, p. 10347-10360, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | MACHADO, T. F.; MICHELOTTI, V. T.; BARBEIRO, L. W.; MELO, T. P. de; OTTO, P. I.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; MELLO, F. C. B.; RORATO, P. R. N. Análises de componentes principais e correlação de Spearman para a determinação de características a serem utilizadas em programas de melhoramento de poedeiras. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | NEGRI, R.; DALTRO, D.; KLUSKA, S.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; OLIVEIRA, H. R. de; COBUCI, J. A.; SILVA, M. V. G. B. Genomic-enhanced breeding values for heat stress tolerance in Girolando cattle in Brazil. Livestock Science, v. 278, 105360, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | BARBEIRO, L. W.; MICHELOTTI, V. T.; MACHADO, T. F.; MELO, T. P. de; OTTO, P. I.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; MELLO, F. C. B.; RORATO, P. R. N. Herdabilidade para características produtivas, reprodutivas e de qualidade do ovo em três linhagens poedeiras. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 12. | | VERARDO, L. L.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; REIS, D. R. de L.; EGITO, A. A. do; VITORINO, A. S. M.; CAROLINO, M. I. C. M.; CAROLINO, N. P.; SILVA, M. V. G. B. Exploring the genetic origin of Brazilian locally adapted breeds: admixture, population history and relationship with Portuguese and indicine cattle. Livestock Science, v. 282, 105455, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. | | ROCHA, R. de F. B.; OTTO, P. I.; GARCIA, A. O.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; CALUS, M. P. L.; GUIMARÃES, S. E. F. A genética envolvida na produção de oócitos e embriões em Gir leiteiro. Balde Branco, ano 59, n. 703, p. 56-59, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 14. | | SANTOS, G. B.; CARVALHO, B. C. de; BRANDÃO, F. Z.; VARAGO, F. C.; VARGAS, M. W.; MACHADO, F. S.; CAMPOS, M. M.; CAMARGO, L. S. de A.; OTTO, P. I. Effect of diet energy on the relationship of follicular fluid estrogen and progesterone concentration in postpartum crossbred Holstein x Gir cows. Animal Reproduction, v. 11, n. 3, p. 459, 2014. Edição dos proceedings do 28º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2014, Natal.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 15. | | OLIVEIRA, C. S.; SILVA, M. V. G. B.; QUINTAO, C. C. R.; OTTO, P. I.; ALONSO, R. V.; FERES, L. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; CAMARGO, L. S. de A. Imputation accuracy for genomic selection using embryo biopsy samples in Gir. Reproductive Biology, v. 23, 100765, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | ROCHA, R. de F. B.; OTTO, P. I.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; VERONEZE, R.; LEANDRO, F. D.; PEREIRA, S. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; PANETTO, J. C. do C. Repeatability and random regression models to estimate genetic parameters for oocyte and embryo production in the Gir breed. Animal Production Science, v. 62, n. 17, p. 1661-1670, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. Runs of homozygosity and signatures of selection for number of oocytes and embryos in the Gir Indicine cattle. Mammalian Genome, v. 34, p. 482-496, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | FACO, O.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; OTTO, P. I.; LOBO, A. M. B. O.; FONSECA, J. F. da; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros - Capragene, 3º Sumário de Avaliação Genética, 2º Sumário de Avaliação Genética Genômica, Ano 2020 - Raça Saanen. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2020. 52 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 19. | | ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle. Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 20. | | FACO, O.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; OTTO, P. I.; LOBO, A. M. B. O.; FONSECA, J. F. da; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Sumário Capragene. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2020. 52 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 29 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
09/05/2023 |
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Data da última atualização: |
22/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
OLIVEIRA, C. S.; SILVA, M. V. G. B.; QUINTAO, C. C. R.; OTTO, P. I.; ALONSO, R. V.; FERES, L. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; CAMARGO, L. S. de A. |
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Afiliação: |
CLARA SLADE OLIVEIRA, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; CAROLINA CAPOBIANGO ROMANO QUINTAO, CNPGL; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; RODRIGO VITORIO ALONSO, Nelore Myo Genetica Bovina; LUIZ FERNANDO FERES, Universidade Jose do Rosario Vellano-UNIFENAS; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; LUIZ SERGIO DE ALMEIDA CAMARGO, CNPGL. |
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Título: |
Imputation accuracy for genomic selection using embryo biopsy samples in Gir. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Reproductive Biology, v. 23, 100765, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.repbio.2023.100765 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to establish a platform for genomic selection of in vitro-fertilized (IVF) Gir embryos. Multiple displacement amplification (MDA)-based embryo biopsy samples were genotyped, and genomic estimated breeding values (GEBV) for milk yield (305MY) were calculated. The concordance of GEBV and accuracy between embryo biopsies and the respective liveborn were assessed. Imputation was performed using two panels (Z-Chip and Bovine HD, Illumina) based on a database of 73,110 lactating cow's database and pedigree files from 147,131 animals. Biopsied embryos had similar pregnancy rates (39% vs 40%), pregnancy loss rates (18% vs 20%), and pregnancy length compared to Control embryos. After genotyping, low call rate means were detected for biopsy samples compared to the respective calf samples (0.80 vs 0.98). Imputation presented 0.83 (Z-Chip) and 0.96 (HD) accuracy (CORRanim). Embryo GEBV accuracy levels were higher in BovineHD imputation (0.82) than Z-Chip imputation (0.55) or no imputation (0.62), and the correlation between embryo/calf pairs' accuracy was 0.85 for BovineHD imputation, 0.11 for Z-Chip imputation, and 0.02 for no imputation. GEVB estimates correlation between embryo/calf pairs was 0.87 for BovineHD imputation, 0.80 for Z-Chip imputation, and 0.41 before imputation. The call rate of embryo samples did not affect the correlation between embryo/calf pairs for accuracy and GEBV before and after BovineHD imputation. Embryos obtained on the same farm presented GEBV 305MY differences of up to 800 kg, emphasizing the expected impact of embryo genomic selection for the Gir breed. MenosThe aim of this study was to establish a platform for genomic selection of in vitro-fertilized (IVF) Gir embryos. Multiple displacement amplification (MDA)-based embryo biopsy samples were genotyped, and genomic estimated breeding values (GEBV) for milk yield (305MY) were calculated. The concordance of GEBV and accuracy between embryo biopsies and the respective liveborn were assessed. Imputation was performed using two panels (Z-Chip and Bovine HD, Illumina) based on a database of 73,110 lactating cow's database and pedigree files from 147,131 animals. Biopsied embryos had similar pregnancy rates (39% vs 40%), pregnancy loss rates (18% vs 20%), and pregnancy length compared to Control embryos. After genotyping, low call rate means were detected for biopsy samples compared to the respective calf samples (0.80 vs 0.98). Imputation presented 0.83 (Z-Chip) and 0.96 (HD) accuracy (CORRanim). Embryo GEBV accuracy levels were higher in BovineHD imputation (0.82) than Z-Chip imputation (0.55) or no imputation (0.62), and the correlation between embryo/calf pairs' accuracy was 0.85 for BovineHD imputation, 0.11 for Z-Chip imputation, and 0.02 for no imputation. GEVB estimates correlation between embryo/calf pairs was 0.87 for BovineHD imputation, 0.80 for Z-Chip imputation, and 0.41 before imputation. The call rate of embryo samples did not affect the correlation between embryo/calf pairs for accuracy and GEBV before and after BovineHD imputation. Embryos obtained on the same farm p... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genotipagem. |
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Thesagro: |
Biopsia; Bovino; Embrião Animal; Gado Gir. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02453naa a2200289 a 4500
001 2153627
005 2023-08-22
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024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.repbio.2023.100765$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, C. S.
245 $aImputation accuracy for genomic selection using embryo biopsy samples in Gir.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aThe aim of this study was to establish a platform for genomic selection of in vitro-fertilized (IVF) Gir embryos. Multiple displacement amplification (MDA)-based embryo biopsy samples were genotyped, and genomic estimated breeding values (GEBV) for milk yield (305MY) were calculated. The concordance of GEBV and accuracy between embryo biopsies and the respective liveborn were assessed. Imputation was performed using two panels (Z-Chip and Bovine HD, Illumina) based on a database of 73,110 lactating cow's database and pedigree files from 147,131 animals. Biopsied embryos had similar pregnancy rates (39% vs 40%), pregnancy loss rates (18% vs 20%), and pregnancy length compared to Control embryos. After genotyping, low call rate means were detected for biopsy samples compared to the respective calf samples (0.80 vs 0.98). Imputation presented 0.83 (Z-Chip) and 0.96 (HD) accuracy (CORRanim). Embryo GEBV accuracy levels were higher in BovineHD imputation (0.82) than Z-Chip imputation (0.55) or no imputation (0.62), and the correlation between embryo/calf pairs' accuracy was 0.85 for BovineHD imputation, 0.11 for Z-Chip imputation, and 0.02 for no imputation. GEVB estimates correlation between embryo/calf pairs was 0.87 for BovineHD imputation, 0.80 for Z-Chip imputation, and 0.41 before imputation. The call rate of embryo samples did not affect the correlation between embryo/calf pairs for accuracy and GEBV before and after BovineHD imputation. Embryos obtained on the same farm presented GEBV 305MY differences of up to 800 kg, emphasizing the expected impact of embryo genomic selection for the Gir breed.
650 $aBiopsia
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700 1 $aCAMARGO, L. S. de A.
773 $tReproductive Biology$gv. 23, 100765, 2023.
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